Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms