Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM2Q9BVW6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM2Q9BVW6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM2Q9BVW6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM2Q9BVW6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM2Q9BVW6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM2Q9BVW6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM2Q9BVW6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM2Q9BVW6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM2Q9BVW6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM2Q9BVW6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM2Q9BVW6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM2Q9BVW6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM2Q9BVW6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM2Q9BVW6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM2Q9BVW6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SMIM2Q9BVW6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SMIM2Q9BVW6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM2Q9BVW6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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