Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3CQ9BUI4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms