Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS4Q9BT78 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms