Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms