Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms