Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUDCD1Q96RS6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms