Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf85Q96MD7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms