Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms