Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms