Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
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