Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms