Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BORCS6Q96GS4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BORCS6Q96GS4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BORCS6Q96GS4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BORCS6Q96GS4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BORCS6Q96GS4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BORCS6Q96GS4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BORCS6Q96GS4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BORCS6Q96GS4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BORCS6Q96GS4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BORCS6Q96GS4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BORCS6Q96GS4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms