Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGF29Q96ES7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
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