Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EAF2Q96CJ1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EAF2Q96CJ1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms