Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms