Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms