Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms