Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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ZNF248Q8NDW4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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ZNF248Q8NDW4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ZNF248Q8NDW4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ZNF248Q8NDW4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ZNF248Q8NDW4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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ZNF248Q8NDW4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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ZNF248Q8NDW4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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ZNF248Q8NDW4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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ZNF248Q8NDW4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF248Q8NDW4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF248Q8NDW4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF248Q8NDW4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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