Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATG16L2Q8NAA4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATG16L2Q8NAA4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L2Q8NAA4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L2Q8NAA4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L2Q8NAA4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L2Q8NAA4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L2Q8NAA4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L2Q8NAA4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L2Q8NAA4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L2Q8NAA4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L2Q8NAA4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L2Q8NAA4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L2Q8NAA4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L2Q8NAA4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L2Q8NAA4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L2Q8NAA4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L2Q8NAA4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L2Q8NAA4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms