Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTC29Q8NA56 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTC29Q8NA56 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTC29Q8NA56 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTC29Q8NA56 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTC29Q8NA56 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTC29Q8NA56 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTC29Q8NA56 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTC29Q8NA56 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTC29Q8NA56 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TTC29Q8NA56 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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