Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms