Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms