Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIX1LQ8IVB5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
LIX1LQ8IVB5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LIX1LQ8IVB5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIX1LQ8IVB5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIX1LQ8IVB5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIX1LQ8IVB5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIX1LQ8IVB5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIX1LQ8IVB5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms