Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP13Q86W25 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms