Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA8AQ86V59 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA8AQ86V59 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA8AQ86V59 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA8AQ86V59 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA8AQ86V59 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA8AQ86V59 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA8AQ86V59 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA8AQ86V59 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA8AQ86V59 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA8AQ86V59 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA8AQ86V59 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA8AQ86V59 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA8AQ86V59 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA8AQ86V59 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA8AQ86V59 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA8AQ86V59 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA8AQ86V59 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms