Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT28Q7Z3Y7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms