Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC46A3Q7Z3Q1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms