Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NUP54Q7Z3B4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms