Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KNDC1Q76NI1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNDC1Q76NI1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms