Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP47Q6ZTR5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP47Q6ZTR5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP47Q6ZTR5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP47Q6ZTR5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP47Q6ZTR5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP47Q6ZTR5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CFAP47Q6ZTR5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CFAP47Q6ZTR5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CFAP47Q6ZTR5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CFAP47Q6ZTR5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CFAP47Q6ZTR5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CFAP47Q6ZTR5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CFAP47Q6ZTR5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CFAP47Q6ZTR5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CFAP47Q6ZTR5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFAP47Q6ZTR5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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