Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms