Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms