Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGMBQ6NW40 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms