Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms