Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms