Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NANOGP8Q6NSW7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms