Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms