Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC102BQ68D86 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms