Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms