Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms