Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47AQ5JRC9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms