Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms