Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms