Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFTN2Q52LD8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms