Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms