Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms