Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDNFQ49AH0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms