Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms