Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BSXQ3C1V8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms